Deveti Doktor je inkarnacija Doktora, protagonista BBC-jeve znanstveno-fantastične serije Doctor Who. Glumi ga Christopher Eccleston tokom prve sezone nove serije, u 2005. Unutar serije, Doktor je humanoidni izvanzemaljac, putnik kroz vrijeme. Pripada rasi Gospodara vremena. Kad se Doktor nađe pred smrću, može se regenerirati, no tad mu se mijenja fizički izgled i osobnost.
Pristup produkcijskog tima prema liku i Ecclestonovoj izvedbi bio je namjerno drukčiji od njegovih prethodnika, prema Ecclestonu, lik je manje ekscentričan. Kako bi se uklopio s publikom 21. stoljeća, liku je dodijeljen neovisan i hrabar suputnik, poput samog Doktora, u formi Rose Tyler. Također kratko putuje s Adamom Mitchellom, sebičnim mladićem genijalcem, koji postaje uzrok problema, te se pokazuje nedostojan putovanja TARDIS-om, i Jackom Harknessom, bivšim vremenskim agentom iz 51. stoljeća. Doktor, Rose i Jack postaju tim s bliskim odnosima, no bivaju razdvojeni u finalnoj epizodi 1. sezone, u kojoj svaki lik mora donijeti teške odluke i žrtvovati se.
2006., čitatelji Doctor Who Magazine-a izglasali su Ecclestonova Doktora trećim najpopularnijim Doktorom. Posebno su hvaljene interakcije između Doktora i njegovih dušmana, Daleka. Eccleston je osvojio nekoliko nagrada za glumu u jednoj sezoni, među kojima je i National Television Award 2005. za najboljeg glumca.